コア研究部門
| 進化発生生物学部門： 教授 赤坂甲治 | 進化生理学部門： 特任教授 窪川かおる |
| 再生生物学部門： 准教授 近藤真理子 | 分子細胞生物学部門： 准教授 吉田 学 |
| ゲノム進化学部門： 助教 黒川大輔 | 系統分類進化学部門： 助教 大森紹仁 |
協力研究部門
| 比較生化学部門： 教授 渡部終五 | 海洋生物進化学： 教授 西田 睦 |
| 比較生理学部門： 教授 竹井祥郎 | 海洋微生物動態部門： 教授 木暮一啓 |
| 生体情報学部門： 教授 岡 良隆 | 深海生物学部門： 教授 小島茂明 |
| 進化細胞生物学部門： 准教授 真行寺千佳子 | |
